பீபேசு
பீபேசு (BeeBase)(தமிழாக்கம் = தேனீத் தரவுத்தளம்) என்பது இணையவழி உயிர் தகவலியல் தரவுத்தளமாகும். இது ஐரோப்பியத் தேனீயான, ஏபிசு மெலிபெரா, சில நோய்க்கிருமிகள் மற்றும் பிற சிற்றினங்கள் தொடர்பான தரவுகளைக் கொண்டுள்ளது. இத்தரவுத் தளம் தேனீ மரபணு வரிசைப்படுத்தல் கூட்டமைப்புடன் இணைந்து உருவாக்கப்பட்டது.[1] 2020-ல் இது காப்பகப்படுத்தப்பட்டு கைமினோப்டெரா மரபணு தொகுப்பு தரவுத்தளத்தால் மாற்றப்பட்டது.
தகவல்கள்
தொகுபின்வரும் நோய்க்கிருமிகளுடன் ஏபிசு மெல்லிபெராவுக்கான மரபணு வரிசையை இத்தளம் வழங்குகிறது:
- பாம்பசு டெரெசுட்ரிசு
- பாம்பசு இம்பேடியென்சு[1]
இரண்டு கூடுதல் சிற்றினங்கள் பகுப்பாய்வில் உள்ளன:
- ஏபிசு டார்சாட்டா
- ஏபிசு புளோரியா[1]
பிப்ரவரி 2007-ல், பீபேசானது கூகிள் குரோம் அடிப்படையிலான ஜீனோம் வியூவர் மற்றும் [சிமேப்-அடிப்படையிலான] ஒப்பீட்டு வரைபட பார்வையாளரைக் கொண்டிருந்தது. இவை இரண்டும் பொதுநிலை மாதிரி உயிரியல் தரவுத்தளம் (GMOD) திட்டத்தின் தொகுதிகளாகும். மரபணு பார்வை உலாவி மூலம் அறியப்பட்ட தேனீ மரபணுக்கள், கணிக்கப்பட்ட மரபணு தொகுப்புகள் (Ensembl, NCBI, EMBL-Heidelberg), STS குறிப்பான்கள் (Solignac மற்றும் Hunt இணைப்பு வரைபடங்கள்), தேனீ வெளிப்படுத்தப்பட்ட வரிசை குறிச்சொற்கள் (ESTகள்), பழ ஈ, கொசுக்கள் மற்றும் அமைப்பொத்த தகவலுக்கான தடங்கள் பூச்சிகள் மற்றும் இடமாறும் டி. என். ஏ. கூறுகள் ஆகியவை அடங்கும். தேனீ ஒப்பீட்டு வரைபட பார்வையாளர் இணைப்பு வரைபடங்கள் மற்றும் இயற்பியல் வரைபடம் ஆகியவற்றைக் காட்டினார். இது வரைபடங்களில் பொதுவான குறிப்பான்களைக் காட்டுகிறது.
பீபேசுக்காக திட்டமிடப்பட்ட எதிர்கால மேம்பாடுகள் க்யுடிஎல் வீவர் மற்றும் மரபணு வெளிப்பாடு தரவுத்தளமாகும். இந்த மாறுபட்ட தரவு வகைகளை இணைக்க மரபணு வரிசை ஒரு மேற்கோள் தளமாகச் செயல்படும்.
பீபேசில் கிடைக்கும் உயிரியல் தரவு மற்றும் சேவைகள் பின்வருமாறு:
- டி. என். ஏ. மற்றும் புரத வரிசை தரவு
- அதிகாரப்பூர்வ தேனீ மரபணு தொகுப்பு (பீபேசு உருவாக்கப்பட்டு வெளியிடப்பட்டது)
- மரபணு உலாவி
- மரபணு இணைப்பு வரைபடங்கள்
- பிளாசுடினைப் பயன்படுத்தி தேனீ மரபணுவைத் தேட சேவையகம்
பீபேஸ் பேய்லர் மருத்துவக் கல்லூரி மனித மரபணுத்தொகை மரபணு வரிசைப்படுத்தல் மையத்துடன் இணைந்து தேனீ மரபணுவின் உரை விளக்க நிகழ்வினை ஏற்பாடு செய்தது.[2]
மேற்கோள்கள்
தொகு- ↑ 1.0 1.1 1.2 BeeBase website - http://hymenopteragenome.org/beebase/
- ↑ Elsik, C. G.; Worley, K. C.; Zhang, L.; Milshina, N. V.; Jiang, H.; Reese, J. T.; Childs, K. L.; Venkatraman, A. et al. (25 October 2006). "Community annotation: Procedures, protocols, and supporting tools". Genome Research 16 (11): 1329–1333. doi:10.1101/gr.5580606.